Added biological process info to the small smokers example, and a README file to
explain the dataset, at least the non-trivial parts.
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parent
3dc1867be4
commit
0eff457910
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@ -0,0 +1,7 @@
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smoker_example_go_bp.txt
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Mapping of entrez GeneIDs to GO terms in the biological process namespace.
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The first column is the GeneID, and the rest of the columns are individual
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GO terms that are assigned to that gene.
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@ -0,0 +1,125 @@
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3417 GO:0005975 GO:0006092 GO:0006097 GO:0006099 GO:0006102 GO:0008152
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131 GO:0006069 GO:0006118
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2597 GO:0006006 GO:0006096 GO:0006096 GO:0007154 GO:0006413 GO:0006006 GO:0006096 GO:0006096 GO:0007154 GO:0006413 GO:0006006 GO:0006096 GO:0006096 GO:0007154 GO:0006413 GO:0006006 GO:0006096 GO:0006096 GO:0006006 GO:0006096 GO:0006096 GO:0006006 GO:0006096 GO:0006096
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3419 GO:0005975 GO:0006099 GO:0008152 GO:0005975 GO:0006099 GO:0008152
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2524 GO:0005975 GO:0006486 GO:0006486 GO:0042355 GO:0005975 GO:0005975 GO:0006486 GO:0006486 GO:0042355 GO:0005975
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4144 GO:0006730 GO:0006730
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9836
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4907 GO:0006259 GO:0009166
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2952 GO:0006950
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27163
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10588 GO:0008152 GO:0015942 GO:0008152 GO:0015942
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80025 GO:0015937
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114049
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126 GO:0006066 GO:0006069 GO:0006066 GO:0006069
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6715 GO:0007267 GO:0007530 GO:0007548 GO:0030154 GO:0007267 GO:0007530 GO:0007548 GO:0030154 GO:0007267 GO:0007530 GO:0007548 GO:0030154
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132 GO:0006166 GO:0009156 GO:0006166 GO:0009156
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2990 GO:0005975 GO:0006027 GO:0005975 GO:0030203
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3035 GO:0006412 GO:0006427 GO:0006412 GO:0006418
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56922 GO:0006552 GO:0006768 GO:0008152
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6652 GO:0006060 GO:0007601 GO:0006060 GO:0007601
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3032 GO:0006629 GO:0006631 GO:0006635
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3033 GO:0006629 GO:0006631 GO:0006629 GO:0006631 GO:0006629 GO:0006631
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8704 GO:0005975
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55229 GO:0015937
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51071 GO:0009264
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4329 GO:0006220 GO:0006573 GO:0006573 GO:0008152 GO:0019859 GO:0006573 GO:0006220 GO:0006573 GO:0006573 GO:0008152 GO:0019859 GO:0006573 GO:0006220 GO:0006573 GO:0006573 GO:0008152 GO:0019859 GO:0006573 GO:0006220 GO:0006573 GO:0006573 GO:0008152 GO:0019859 GO:0006573 GO:0006220 GO:0006573 GO:0006573 GO:0008152 GO:0019859 GO:0006573
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587 GO:0008152 GO:0009082 GO:0008652 GO:0009081 GO:0009082 GO:0008152 GO:0009082 GO:0008652 GO:0009081 GO:0009082
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191 GO:0006730 GO:0006730
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4522 GO:0000105 GO:0006164 GO:0006730 GO:0008652 GO:0009086 GO:0009396
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115 GO:0006171 GO:0007242 GO:0009190 GO:0007165 GO:0006171 GO:0007242 GO:0009190 GO:0007165 GO:0006171 GO:0007242 GO:0009190 GO:0007165
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65985 GO:0008152 GO:0008299
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1486 GO:0005975 GO:0006032 GO:0007165 GO:0007186 GO:0007165 GO:0005975 GO:0006032 GO:0007165 GO:0007186 GO:0007165
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27430 GO:0006556 GO:0006556 GO:0045226
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4200 GO:0006108 GO:0006108 GO:0006468 GO:0007165 GO:0007242 GO:0006108
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9380 GO:0006118 GO:0006564 GO:0007588 GO:0008152 GO:0008152 GO:0006118 GO:0006564 GO:0007588 GO:0008152 GO:0008152 GO:0006118 GO:0006564 GO:0007588 GO:0008152 GO:0008152
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||||
1716 GO:0006139 GO:0008617 GO:0006139 GO:0008617
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3028 GO:0006629 GO:0008152
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1718 GO:0006118 GO:0006695 GO:0006695 GO:0006915 GO:0006916 GO:0006979 GO:0007050 GO:0009888 GO:0043154 GO:0043526 GO:0043588 GO:0006694 GO:0006695 GO:0008610 GO:0016126
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2987 GO:0006183 GO:0000723 GO:0007004 GO:0006183
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5096 GO:0009062
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3157 GO:0006084 GO:0006629 GO:0006695 GO:0006694 GO:0008610 GO:0016126 GO:0006084 GO:0006629 GO:0006695 GO:0006694 GO:0008610 GO:0016126
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||||
2752 GO:0001505 GO:0006542 GO:0006807 GO:0006542 GO:0001505 GO:0006542 GO:0006807 GO:0006542 GO:0001505 GO:0006542 GO:0006807 GO:0006542
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2879 GO:0006118 GO:0006644 GO:0006979 GO:0007275
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8833 GO:0006164 GO:0006177 GO:0006541 GO:0009058 GO:0009113
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||||
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|
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|
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|
||||
8566
|
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|
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231 GO:0005975
|
||||
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|
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|
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2730 GO:0006534 GO:0006750
|
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|
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|
||||
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|
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|
||||
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|
||||
54187 GO:0009103 GO:0016051
|
||||
2878 GO:0006982 GO:0042744 GO:0051289 GO:0006979 GO:0006982 GO:0042744 GO:0051289 GO:0006979
|
||||
290 GO:0001525 GO:0006508 GO:0030154 GO:0007275
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